Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms