Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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