Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MSI1O43347 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MSI1O43347 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms