Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H7C1W4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H7C1W4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms