Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms