Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms