Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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