Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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