Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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TCIRG1Q13488 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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