Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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