Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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