Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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