Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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