Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms