Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR1208-201ENST00000408334 73 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01985-201ENST00000450746 436 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL397P-201ENST00000487309 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC026415.1-201ENST00000505404 471 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00499-204ENST00000515282 579 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC137800.1-202ENST00000562098 446 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL44P-201ENST00000583849 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-218ENST00000601257 704 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.155-201ENST00000616367 282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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