Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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VPS72Q15906 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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