Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RFTN1Q14699 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms