Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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