Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SRSF5Q13243 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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