Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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