Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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