Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP17L8P0C7I0 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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