Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CCDC93Q567U6 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CCDC93Q567U6 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC93Q567U6 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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