Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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