Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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