Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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