Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms