Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms