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| FOXE3 | Q13461 | OR1D2-201 | ENST00000331459 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TSLP-201 | ENST00000344895 | 736 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNA5SP346-201 | ENST00000363541 | 121 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RABGGTB-202 | ENST00000370826 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TCEAL7-202 | ENST00000372666 | 852 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-877P-201 | ENST00000383868 | 107 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC003035.1-201 | ENST00000391359 | 544 nt | TSL 3 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIR1284-201 | ENST00000408337 | 120 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UBE2V1P14-201 | ENST00000415815 | 558 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC079760.2-203 | ENST00000418395 | 489 nt | TSL 3 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC083900.1-201 | ENST00000421964 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SDCBP-203 | ENST00000424270 | 1277 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PLA2G12AP2-201 | ENST00000424744 | 264 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL138799.2-201 | ENST00000439024 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC024908.1-202 | ENST00000441907 | 764 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL035416.1-201 | ENST00000443012 | 767 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPL5P7-201 | ENST00000444235 | 813 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LINC01758-201 | ENST00000448001 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC074386.1-201 | ENST00000476560 | 767 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC096708.3-201 | ENST00000584226 | 559 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM37-212 | ENST00000584889 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | DYNLL1P1-201 | ENST00000595442 | 269 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF418-210 | ENST00000600989 | 597 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC010200.2-201 | ENST00000605098 | 235 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC103710.1-201 | ENST00000610003 | 901 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL031658.2-201 | ENST00000616850 | 651 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL139089.1-201 | ENST00000620372 | 975 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SMIM18-202 | ENST00000626298 | 114 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTND5P23-201 | ENST00000430812 | 1655 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | THAP6-201 | ENST00000311638 | 3549 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC140134.1-201 | ENST00000511830 | 3544 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF253-203 | ENST00000589717 | 3519 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CENPI-204 | ENST00000423383 | 2314 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYBL1-206 | ENST00000524176 | 2148 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GVINP1-201 | ENST00000526769 | 8438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF682-209 | ENST00000597972 | 1538 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CPS1-212 | ENST00000619804 | 1542 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM205BP-203 | ENST00000455647 | 3752 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NRXN1-242 | ENST00000635519 | 3553 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNMT-201 | ENST00000262173 | 6051 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMPRSS11BNL-202 | ENST00000510782 | 3202 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACPP-202 | ENST00000351273 | 1783 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNF150-202 | ENST00000420921 | 3673 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HSPA8P17-201 | ENST00000427029 | 1382 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AKAP7-201 | ENST00000263050 | 2238 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEL1L3-203 | ENST00000502949 | 3500 nt | TSL 2 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTOR-202 | ENST00000376838 | 4017 nt | TSL 2 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MECOM-201 | ENST00000264674 | 4900 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FOXP2-202 | ENST00000360232 | 1412 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CDH13-209 | ENST00000567109 | 8042 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MOB1B-201 | ENST00000309395 | 6963 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HHLA2-206 | ENST00000467761 | 2379 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ALB-214 | ENST00000509063 | 1911 nt | TSL 5 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR5AS1-202 | ENST00000641320 | 7860 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LUZP2-201 | ENST00000336930 | 3553 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PLCB4-201 | ENST00000278655 | 5430 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNORD8-201 | ENST00000363915 | 110 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF669-202 | ENST00000366500 | 489 nt | TSL 3 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C1orf189-201 | ENST00000368525 | 387 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.409-201 | ENST00000383990 | 98 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-483P-201 | ENST00000384088 | 108 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RN7SKP121-201 | ENST00000410842 | 305 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL035422.1-201 | ENST00000414193 | 397 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC018878.1-201 | ENST00000419904 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL157786.1-206 | ENST00000424422 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | OR3D1P-201 | ENST00000438288 | 955 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL831737.1-201 | ENST00000441288 | 271 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |