Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms