Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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