Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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