Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms