Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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MKRN3Q13064 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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MKRN3Q13064 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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MKRN3Q13064 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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MKRN3Q13064 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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