Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTP4A2Q12974 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTP4A2Q12974 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTP4A2Q12974 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTP4A2Q12974 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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