Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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