Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms