Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GHRHR-204ENST00000409316 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC007785.1-201ENST00000597989 332 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms