Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 418 ms