Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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