Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KCNT1Q5JUK3 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms