Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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