Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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