Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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