Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms