Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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