Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RFXAPO00287 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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