Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms