Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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