Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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