Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms